Najwyższym organem samorządu jest Krajowy Zjazd Diagnostów Laboratoryjnych.
Krajowa Rada Diagnostów Laboratoryjnych kieruje działalnością samorządu w okresach między Zjazdami.
Rada wykonuje obowiązki wynikające z ustawy i uchwał Krajowego Zjazdu Diagnostów Laboratoryjnych w drodze działań własnych lub Prezydium KRDL.
Prezydium Krajowej Rady Diagnostów Laboratoryjnych stanowią Prezes Krajowej Rady oraz wybrani przez Krajową Radę wiceprezesi, Sekretarz, Skarbnik i Członkowie Prezydium. Prezydium Krajowej Rady działa w imieniu Krajowej Rady w sprawach określonych uchwałą Krajowej Rady, z wyjątkiem uchwalania budżetu. Prezydium działa w granicach określonych przez KRDL i przed nią odpowiada.
Prezes KRDL:
- reprezentuje KRDL,
- kieruje pracami KRDL,
- przewodniczy posiedzeniom KRDL,
- podpisuje decyzje w sprawach wpisu na listę diagnostów laboratoryjnych lub skreślenia z niej oraz w innych sprawach wynikających z przepisów Ustawy,
- wydaje zarządzenia w sprawach dotyczących wewnętrznego funkcjonowania KIDL, które nie zostały zastrzeżone do zadań KRDL,
- Prezes KRDL w imieniu KRDL przekazuje Ministrowi uchwały podjęte przez KRDL w terminie do 30 dni od dnia ich uchwalenia.
Komisja Rewizyjna powołana jest przez Zjazd w celu kontroli działalności finansowej i gospodarczej Krajowej Rady
Sąd Diagnostów Laboratoryjnych i Wyższy Sąd Diagnostów Laboratoryjnych rozpatrują sprawy odpowiedzialności zawodowej diagnostów laboratoryjnych. W pierwszej instancji sprawy te rozpatruje Sąd Diagnostów Laboratoryjnych, natomiast w drugiej instancji - Wyższy Sąd Diagnostów Laboratoryjnych. Przewodniczący Sądu Diagnostów Laboratoryjnych i Przewodniczący Wyższego Sądu Diagnostów Laboratoryjnych kierują sądami, a w szczególności:
- zaznajamiają się z pismami wpływającymi do sądu i wydają odpowiednie zarządzenia,
- zapewniają stronom możliwość przeglądania akt sprawy, organizują spotkania sędziów dla omówienia zagadnień prawnych budzących wątpliwości oraz dla omówienia zagadnień organizacyjnych, usprawniających i doskonalących przebieg postępowania dyscyplinarnego,
- zapewniają sprawną, prawidłową i terminową pracę obsługi administracyjnej sądu.
Rzecznik Odpowiedzialności Zawodowej:
- wykonuje czynności sprawdzające i prowadzi postępowanie wyjaśniające w sprawach z zakresu odpowiedzialności zawodowej,
- sprawuje funkcję oskarżyciela przed Sądem Diagnostów Laboratoryjnych i Wyższym Sądem Diagnostów Laboratoryjnych,
- składa Krajowemu Zjazdowi roczne i kadencyjne sprawozdania z działalności,
- organizuje dla członków samorządu szkolenia z zakresu odpowiedzialności zawodowej,
Zastępcy Rzecznika działają w imieniu i na rzecz Rzecznika.
Zespół Wizytatorów
Wizytatorzy przeprowadzają postępowania kontrolne mające na celu ocenę wykonywania czynności medycyny laboratoryjnej przez diagnostę laboratoryjnego dokonaną na podstawie ustalonego stanu faktycznego przy zastosowaniu przyjętych kryteriów kontroli.